南京辞职后医保的办理流程如下：

1. 辞职前咨询：在辞职之前，可以向所在单位的人力资源部门咨询有关医保的政策和办理流程。他们会告知你具体的操作步骤和所需材料。

2. 申请办理：辞职后，你需要前往当地的社会保险局或人力资源社会保障局办理医保手续。在办理时，需要携带个人身份证、社保卡、劳动合同、离职证明等相关材料。

3. 注销原单位医保：在办理医保手续时，你需要填写注销原单位医保的申请表，并提交相关证明文件，如离职证明、劳动合同等。社保局会根据这些材料进行核验，并办理注销手续。

4. 新单位医保转移：如果你已经找到新的工作，可以将原有的医保转移到新单位。在办理医保手续时，你需要提交新单位的劳动合同、身份证等相关材料，并填写转移医保的申请表。

5. 个人医保缴纳：如果你没有找到新的工作，可以选择自行缴纳个人医保。在办理手续时，你需要填写个人医保的申请表，并缴纳相应的费用。

6. 医保卡办理：在办理医保手续完成后，你会获得一张医保卡。这张卡可以在医院就诊时使用，享受医保报销的福利。

需要注意的是，具体的办理流程和所需材料可能会因地区而异，建议你在办理前提前咨询当地的社保局或人力资源社会保障局，以获取准确的信息。